济宁医学院暂拥有北湖和日照两个校区,校舍建筑总面积约合39万平方米,藏书160万册,中外文期刊2000余种,教学、科研仪器设备总值1.76亿余元。北湖校区坐落在孔孟 之乡、礼仪之邦、素有江北小苏州之称的济宁市北湖旅游度假区。日照校区坐落在黄海之滨、素有“东方夏威夷”之称的日照市,整个校区依山傍水,藏风聚气,汇脉纳川,卧虎蛰龙。